2025年9月，穆里尼奥在本菲卡训练基地接受欧足联采访时，称费内巴切是其职业生涯中唯一让他觉得“没在这里创造历史”的地方。
2024年6月，穆里尼奥接手费内巴切，球迷期待他能复制在罗马的欧战奇迹。他带队初期表现不错，欧冠资格赛首秀4-3逆转卢加诺，土超首轮1-0取胜，还一度打出联赛五连胜。但在2025年8月的欧冠资格赛附加赛中，费内巴切总比分0-1不敌本菲卡，连续两年无缘正赛，36小时后，俱乐部宣布解雇穆里尼奥。
穆里尼奥在费内巴切执教14个月，带队62场取得37胜14平11负的战绩，但未能夺冠，土超冠军被加拉塔萨雷夺走，欧联杯也未能突破淘汰赛。他认为土耳其联赛的独特环境是一大挑战，费内巴切球迷崇尚进攻，而他的实用主义风格偏重防守反击，这种理念差异让他受到部分当地媒体批评。此外，球队阵容深度不足，他的强硬管理方式在文化差异下也未能完全奏效。
与在费内巴切的经历不同，穆里尼奥在波尔图、切尔西、国际米兰、皇马、曼联、罗马等队都有冠军斩获，这也使得费内巴切成为他辉煌生涯中的唯一空白。
